האגף לכירורגיה מאגד בתוכו 18 מחלקות שהמשותף ביניהן הוא  ביצוע ניתוחים. בפעלו במסגרת מרכז רפואי-על, הוא מגיש שירותים כוללניים בכל המקצועות הכירורגיים.

עם התקדמות המרשימה בכירורגיה המודרנית, אנו מעודדים התמחות ושאיפה למצוינות בכל התחומים. הדבר נעשה ע"י יצירת יחידות מיוחדות במסגרת המחלקות אשר בהן מצטברים יידע וניסיון. עם זאת, אנו משתדלים לא לאבד את הראייה הכוללת של האדם החולה על מגוון בעיותיו. ברוח זו אנו מעודדים שיתוף פעולה בין היחידות השונות וגישה רב-תחומית לפתרון מצבים סבוכים, כגון בטיפול בפציעות רב-מערכתיות.

המנתחים הבכירים שלנו השלימו כולם התמחויות נוספות במרכזים הרפואיים המובילים בעולם ומשתתפים בקביעות בכינוסים מדעיים רפואיים בין-לאומיים. אנו מעודכנים לפיכך בהתפתחויות האחרונות בתחומי הכירורגיה ומיישמים אותן לטובת המטופלים.
דוגמא בולטת היא השימוש הנרחב בטכניקות של פולשנות מזערית המאפשרת ביצוע ניתוחים מורכבים עם מינימום סבל לחולים ועם הפחתה ניכרת של התחלואה.

בנוסף, לפעילות הקלינית, מחלקות האגף לכירורגיה משקיעות מאמץ רב בהוראה לסטודנטים לרפואה ולמתמחים ובמחקר, כיאה למרכז אוניברסיטאי.